王原祁的山水画，大致分为三个阶段，第一阶段为早期，基本上“秉承家学，气味深醇，盖得力于古者深也。”这时，多为学王时敏画风，以临摹前人之画为主。第二阶段为中年时期，画技逐渐完善，逐渐形成他自己的风格，构图完密，脉络清晰，笔墨秀润，景色高旷，多有黄公望之法，同时又有他的干笔淡墨多次皴擦勾染的技巧。秦祖永在《桐阴论画》中说他“中年秀润”，“凡作一图，沈雄骀宕。元气淋漓笔端。”第三阶段，大约60岁以后。老年时期，笔墨苍劲，色彩平和，墨色中互不相碍。追求拙扑，纯熟老练，有“熟而后生”之意味，所以秦祖永又说他的画“晚年苍浑”。所画“山石，妙如云气腾溢，模糊蓊郁，一望无际，真高出诸家之上。”